2007-09-24 10:39:55
『統計解析環境Ｒによるバイオインフォマティクスデータ解析』（4300円＋税／共立出版）[amazon.co.jp, bk1,
紀伊國屋書店]という本を買って、早速GGobiをインストールしてみた。多次元データを視覚的に表示するものらしい。Linux版をダウンロードして、
./configure --with-all-plugins make sudo make install make ggobirc sudo mkdir -p /etc/xdg/ggobi sudo cp ggobirc /etc/xdg/ggobi/ggobircとやればいいというのでやってみると足りないものがあって、libgtk2.0-devとlibxml2-dev、libjpeg62-devをSynapticを使って追加した（もちろんaptでもいい）。いよいよsudo make installとしようと思ったところで、Synapticでggobiとr-omegahat-ggobiがインストールできることに気がついた。後者は普通rggobiと呼ばれているもののことだろう。コンパイルしたものはそのままにして、Synapticから二つをインストールした。
続いて本に書いてあるように
ggobi (ggobi_find_file("data", "flea.xml"))
と入力してみたら、
bash: syntax error near unexpected token 'ggobi_find_file'
というエラーが出てしまった。どうなっているんだ。ただ、ggobiと打ってGGobiを起動し、さきほどコンパイルしたフォルダの中にあるdata/flea.xmlを開いたら、本に載っているような例が出てきた。Synapticでインストールすると、こういうデータはどこに入るのだろう。それともインストールされないのか。
話は変わるが、今まで/etc/crontabを直接編集していたのだが、あちこちでcrontab -eで編集せよみたいなことを見かけるので、そうしてみたら全然指示していることが実行されないではないか。どういう訳なんだと思ったら、root権限で実行するのはここに書いては動かなくて、やはり/etc/crontabに書き込むらしい。そうなのか、本当にそうなのか。とりあえず、root権限で実行する項目は/etc/crontabに戻した。